2000年阿扁競選總統時，中研院長李遠哲為阿扁挺身說服全國民眾，在他的說詞中國民黨是黑金與貪腐的代名詞，認為台灣在國民黨領導下，是逐漸向下沈淪，希望阿扁政府一定能使台灣向上提昇，他呼籲人民認同阿扁、支持阿扁，當總統府易主後，李院長更成為扁政府重要的角色，國正顧問團的團長、ＡＰＥＣ代表團長、九二一重建委員會委員長凡是別人做不來的，李院長一人都扛下，李遠哲已經成為扁政府麻醉台灣人民最佳的迷藥，只要行不通的政策，抬出李院長便有如買到全額的保障般．
但是，曾幾何時阿扁總統弊案連連，施明德先生發起百萬人倒扁運動，台灣社會煞時間有如沸騰的熱鍋水，短短四天之內捐款捐款便逼近六千萬大關，捐款支持倒扁儼然是最熱門的運動，街頭巷尾人人討論，連台東都蘭這個純樸的原住民小村落，也有許多人投入，郵局的局長是我多年前在憲兵學校的學生，一見面便說[要捐款嗎?]而在櫃檯前排隊的原住民朋友用燦爛與期待的笑容回應他，在這裡我們看到台灣基層角落的聲音，所以，我要呼籲李院長您也應該出面表達意見，出示您捐款給這次運動的匯票收據，用您高道德標準與超高的智慧告訴民眾[我們要向上提升的第一步就是促使一個不稱職的總統下台，就是要一個貪腐的領導人及其家人接受國法的制裁]。
李院長，我們願意相信您道德、操守與智慧與您的學術成就一樣崇高，您應該站出來說話了!
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